Africa-Places.com listou aprox 7 universidades dentro Maputo. Alguns dos mais bem avaliados universidades dentro Maputo estão- Universidade Eduardo Mondlane, Universidade Eduardo Mondlane, Catholic University of Mozambique - Faculty of Health Sciences, Catholic University of Mozambique - Faculty of Health Sciences, Universidade Tecnica de Mocambique, Universidade Católica de Moçambique - Faculdade de Ciências da Saúde & Universidade Eduardo Mondlane.